มีการแบ่งส่วนราชการเป็นฝ่าย เพื่อให้บริการด้านการรักษาผู้ป่วย จิตวิทยา, ผู้ป่วยนอก, งานประสาทวิทยา, งานฟื้นฟูสมรรถภาพ, งานจิตเวชและสุขภาพจิตชุมชน, งานทันตกรรม, งานเภสัชกรรม, ฝ่ายสังคมสงเคราะห์, การพยาบาล, บริหารทั่วไป, การสอนและฝึกอบรมแพทย์และบุคลากรทางการแพทย์อื่นๆ

พัฒนาการเด็กและพฤติกรรม, ทารกแรกเกิดและปริกำเนิด, โรคระบบการหายใจ, โลหิตวิทยาและมะเร็งในเด็ก, โรคต่อมไร้ท่อและเมตาบอลิสม, กุมารเวชศาสตร์ โรคหัวใจ, โรคไต, ประสาทวิทยา, อนุสาขากุมารเวชศาสตร์โรคติดเชื้อ, ระบบทางเดินอาหารและโรคตับ, รักษาโรค จักษุวิทยา, จิตเวชศาสตร์, จิตเวชเด็กและวัยรุ่น, นิติเวชศาสตร์, พยาธิวิทยากายวิภาค

โรงพยาบาลเอกชัย เปิดให้บริการรักษาโรคทั่วไป ด้วยทีมแพทย์ผู้เชี่ยวชาญครบทุกสาขา และมีความพิเศษของการบริการที่โดดเด่น ด้วยการมีทีมแพทย์ในสาขาหลักคือ อายุรแพทย์ ศัลยแพทย์ สูตินารีแพทย์ และกุมารแพทย์ อยู่ประจำสามารถรองรับและให้บริการรักษาพยาบาลได้ตลอด 24 ชั่วโมง เพื่อให้ผู้มาใช้บริการมั่นใจได้ว่าจะได้รับการดูแลจากแพทย์อย่างปลอดภัย

บริการทางการแพทย์ ศัลยกรรมผ่าตัด, วิสัญญีวิทยา, พยาธิวิทยา, ธนาคารเลือด, กลุ่มงานจิตเวช, รังสีวิทยา, เวชกรรมฟื้นฟู กายภาพบำบัด, ทันตกรรม, เภสัชกรรม, ดูแลผู้ป่วยนอก, กลุ่มงานอุบัติเหตุฉุกเฉิน, งานอายุกรรม, ศัลยกรรมออร์โธปิดิกส์, สูตินรีเวลชกรรม วางแผนครอบครัวและทำคลอด, กุมารเวชกรรม, จักษุวิทยา, โสต ศอ

ศูนย์แพทยศาสตรศึกษาชั้นคลินิกร่วมผลิตแพทย์เพิ่มเพื่อชาวชนบท ให้บริการงานตรวจรักษาโรคทั่วไป รักษาโรคทางอายุรกรรม โรคเลือด โรคปอด ระบบประสาท โรคข้อ โรคต่อมไร้ท่อ โรคผิวหนัง โรคทางเดินอาหาร บริการผู้ป่วยประกันสังคม คลินิกเบาหวาน ศัลยกรรมทั่วไป ศัลยกรรมหัวใจ หลอดเลือดและทรวงอก ทางเดินปัสสาวะ ศัลยกรรมเด็ก

- ศูนย์ตรวจสุขภาพครบวงจร - ศูนย์บริการประกันสังคมครบวงจร - ศูนย์ทันตกรรมครบวงจร - Package จัดฟัน, Package ตรวจหาความเสี่ยงโรคหัวใจ

- ศูนย์ตรวจสุขภาพครบวงจร - ศูนย์บริการประกันสังคมครบวงจร - ศูนย์ทันตกรรมครบวงจร - Package จัดฟัน, Package ตรวจหาความเสี่ยงโรคหัวใจ

ให้การรักษาโดยแพทย์ ผู้เชี่ยวชาญทุกสาขา อายุกรรม, ศัลยกรรม , ศูนย์มะเร็ง, ศูนย์สุขภาพสตรี, คลีนิคผิวหนัง, สถาบันหัวใจ, รังสีวินิจฉัย, กายภาพบำบัด, แผนกไตเทียม

ให้การรักษาโดยแพทย์ ผู้เชี่ยวชาญทุกสาขา อายุกรรม, ศัลยกรรม , ศูนย์มะเร็ง, ศูนย์สุขภาพสตรี, คลีนิคผิวหนัง, สถาบันหัวใจ, รังสีวินิจฉัย, กายภาพบำบัด, แผนกไตเทียม

ให้การรักษาโดยแพทย์ ผู้เชี่ยวชาญทุกสาขา อายุกรรม, ศัลยกรรม , ศูนย์มะเร็ง, ศูนย์สุขภาพสตรี, คลีนิคผิวหนัง, สถาบันหัวใจ, รังสีวินิจฉัย, กายภาพบำบัด, แผนกไตเทียม